中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库用户手册

来源:http://www.tywogames.com 作者:科技 人气:198 发布时间:2019-08-01
摘要:进行了大幅度更新。目前该数据库涉及近2000例不同组织病理分类、不同WHO恶性度分级、原发/复发中国人群的脑胶质瘤的基因组学数据涵盖全外显测序数据(286例)、mRNA芯片检测数据(

  进行了大幅度更新。目前该数据库涉及近2000例不同组织病理分类、不同WHO恶性度分级、原发/复发中国人群的脑胶质瘤的基因组学数据涵盖全外显测序数据(286例)、mRNA芯片检测数据(301例)、mRNA测序数据(1018例)、microRNA芯片检测数据(198例),以及DNA甲基化芯片数据(159例)。

  此外,该数据库还涉及详尽的临床资料,包括患者性别、年龄、放疗和化疗情况、最长长达4537天的随访数据等。目前,该CGGA数据库中所有数据均为全世界研究者免费开放。针对不同组学数据特点,该研究团队还开发了不同的在线可视化分析工具,包括基因突变图谱,基因表达分布,DNA甲基化模式,相关分析以及生存分析等结果进行可视化。

  脑胶质瘤是成人最常见的颅内原发恶性肿瘤。自2004年起,江涛教授开始致力于中国脑胶质瘤生物样本库的建立及其临床随访数据的收集。在我国神经外科创始人王忠诚院士的指导下,2012年江涛教授作为发起人和创建者启动中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas, CGGA)。经历15年临床标本采集以及组学数据的积累,目前CGGA数据库日臻完善。据不完全统计,已有美国、欧洲等多家知名研究机构近200篇SCI论文引用该数据库。

  该数据库旨在通过基因组学技术结合生物信息学分析方法,全面绘制中国人群的脑胶质瘤基因组图谱,从中探寻脑胶质瘤发生、发展过程中的驱动因子以及关键信号通路,为脑胶质瘤的分子分型和药物靶点研发提供指导和脑胶质瘤精准医学全链条的发展奠定基础,同时也让国内外更多从事脑胶质瘤的研究者可以对该数据库进行有效挖掘与利用。不断建设和完善的CGGA数据库已然走在国家医学科技创新的前列,将不断促进我国脑胶质瘤领域基础和临床研究水平的发展,并提高我国癌症研究的国际影响力,最终推动脑胶质瘤新型诊疗模式的发展,让更多脑胶质瘤患者获益。

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